Dlaczego planowanie ma znaczenie?
Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) to potężne narzędzie, ale jego skuteczność w dużej mierze zależy od starannego przygotowania. Błędy popełnione na etapie projektowania eksperymentu mogą skutkować niską jakością danych lub koniecznością powtórzenia kosztownego sekwencjonowania.
Kluczowe pytania przed zleceniem
Przed przesłaniem próbek należy określić:
- Cel biologiczny — czego szukamy? Wariantów SNP, różnicowej ekspresji, składu taksonomicznego?
- Typ próbki — DNA genomowy, RNA całkowite, wzbogacone frakcje?
- Głębokość pokrycia — ile odczytów potrzebujemy na próbkę?
- Liczbę replikatów — niezbędną dla analiz statystycznych.
Jakość materiału wyjściowego
Jakość i integralność kwasów nukleinowych ma bezpośredni wpływ na wynik sekwencjonowania. Zalecamy ocenę próbek metodą Qubit (stężenie) oraz Agilent Bioanalyzer lub TapeStation (integralność).
Skontaktuj się z nami
Nasz zespół chętnie pomoże zaprojektować eksperyment dostosowany do Twoich potrzeb i budżetu. Zapytaj o ofertę.
